生物菌肥中的有效菌數量，即活菌數是判斷菌肥優劣的重要指標?；罹鷶蹬c菌肥的母液或基質密切相關，如果基質含有較多的氮磷鉀，活菌數就不可能太高，因為PH值的變化和基質的營養不足可能使有益菌不能存活。另外，土壤水分和地溫也是限制生物菌作用的重要因素。購買生物菌肥時，一是要看品牌。二是看有益菌的含量。三是看出廠日期。金土地生物菌肥的施用有基施、穴施、溝施和沖施，施用時要注意土壤濕度，當土壤濕度較大時，生物菌才能繁殖和擴展。其次是土壤溫度要適宜，地溫太高太低都能影響有益菌的存活和作用，一般超過35℃或低于12℃是不適宜的，所以用了生物菌肥后不能進行高溫悶棚。再是生物菌肥可以和有機肥混施，有機肥同時作為有益菌的基質，為其提供更多的營養而增強其活性，但與化肥混施時一定要慎用，尤其是穴施、溝施和沖施時，化肥用量一定要少。另外，使用生物菌肥后，一般不能用殺菌劑進行灌根和沖施，特別是抗生素和銅制劑類。